马克思主义学院承担全校的思政课教学工作。本科阶段承担习近平新时代中国特色社会主义思想概论、马克思主义基本原理、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论、中国近现代史纲要、思想道德与法治、形势与政策等课程。研究生阶段承担自然辩证法概论、中国马克思主义与当代、新时代中国特色社会主义理论与实践等课程。

学院设有行政管理专业，开设管理学原理、政治学原理、行政管理学、当代中国政治制度、政府经济学、组织行为学等课程，培养系统掌握现代行政管理专业理论，知识面开阔，综合素质高，具有较强行政管理能力和相关熟练技能的专门人才。

自2022年起，学院设思想政治教育专业，开设思想政治教育学原理、思想政治教育方法论、中国共产党历史、比较思想政治教育、党建理论与实务、海洋强国理论与实践、航运公共管理、船员思想政治教育等课程，培养具有扎实的马克思主义理论功底和思想政治教育、海洋强国、航运管理等多学科知识基础，能适应社会发展要求，熟悉国际海事规则，掌握我国各级海事等交通运输行政管理机构、港航单位、街道社区、社会团体、大中小学等教育机构的思想政治工作和党建党务工作的理论与方法的专门人才。